Il Dipartimento di Scienze Medico-Chirurgiche si è costituito nel Gennaio del 2003, quale trasformazione dell’Istituto di Scienze Medico Chirurgiche San Donato (attivato nel 1987 sotto la direzione del Prof. Gisberto Fumagalli), con un organico iniziale di 16 tra Professori Ordinari, Associati e Ricercatori. Il Personale Tecnico e amministrativo è rappresentato da sei unità. 

Dallo stesso anno di costituzione, presso il Dipartimento sono stati attivati gli insegnamenti del 1° e 2° semestre del 3°, 4°, 5°, 6° anno del Corso di Laurea in Medicina e Chirurgia, costituendo così una nuova linea autonoma del Polo Centrale (Linea F). Presso la sede del Dipartimento vengono svolte tutte le lezioni formali, le non formali e le attività professionalizzanti dei predetti anni.  

La nuova sede del Dipartimento fornisce ampi e confortevoli spazi per lo svolgimento delle attività didattiche sia formali che non formali. In particolare sono a disposizione dell’Università degli Studi di Milano due piani del nuovo fabbricato.

Al piano terra sono ubicate quattro aule con strutture modulari che ne consentono l’ampliamento in un’unica aula da 350 posti per lo svolgimento di corsi e congressi.

Al primo piano sono disponibili per le attività didattiche quattro aule da 30 posti, una da 10 posti, un'aula manichini e un'aula simulatori, 23 postazioni computerizzate, a disposizione degli studenti, collegate in rete d’ateneo oltre a circa 60 postazioni per studio e consultazione di volumi e riviste, quattro uffici per le attività amministrative. E’ anche disponibile un terminale SIFA.

Una mensa, separata da quella del personale ospedaliero, sarà disponibile per gli studenti.

Il Dipartimento con fondi propri ha provveduto ad attrezzare tutte le aule con apparecchiature audiovisive collegate a postazioni di computer. Otto postazioni di computer collegati in rete di Ateneo sono state messe a disposizione per l’utilizzo da parte del personale. Vengono attuati modelli di didattica sperimentale utilizzando strumenti multimediali con metodi interattivi: questionari a risposta multipla vengono letti ed elaborati in tempo reale, consentendone la visione pressoché immediata in forma grafica. L’attività didattica prevede inoltre una progressiva integrazione con la Medicina di base del territorio e gli Ospedali affiliati allo scopo di ottenere una sempre maggiore professionalizzazione dello studente.                            

Oltre alle attività didattiche per il Corso di Laurea, il Dipartimento è sede della direzione delle Scuole di Specializzazione in Ortopedia e Traumatologia, Chirurgia Plastica e delle relative lezioni teorico-pratiche.  

Molto numerosi sono inoltre i Corsi di aggiornamento, i Seminari, i Congressi, i Corsi di addestramento, organizzati dai Docenti del Dipartimento nelle varie discipline.                                                                                          

L’attività scientifica è stata differenziata nei vari settori in rapporto alla connotazione polispecialistica del Dipartimento.