Il Promoter e' una regione del DNA
ove ha inizio il processo della trascrizione. (link al DATABASE DEI FATTORI DI
TRASCRIZIONE)
Nei procarioti, le sequenze del promoter
sono riconosciute dal Fattore Sigma della RNA polimerasi.
E. coli possiede cinque Fattori Sigma:
* Sigma 70: Regula l'espressione
della maggior parte dei geni.
* Sigma 32: Regula l'espressione delle heat shock proteins.
* Sigma 28: Regula l'espressione dell'operone dei flagelli (coinvolto nel movimento cellulare).
* Sigma 38: Regula l'espressione di geni di risposta agli stress esterni
al batterio.
* Sigma 54: Regula l'espressione di geni coinvolti nel metabolismo dell'azoto.
E. coli Fattori sigma hanno una sequenza consenso specifica circa 10 e 35 (-10 , -35) basi a
monte del sito di inizio della trascrizione (promoters).
(DETTAGLI)
La sequenza consenso e' una sequenza ideale per l'interazione comn le proteine di regolazione.
Un promotore dovrebbe contenere un elemento che e' identico o molto
simile alla sequenza consenso. Esempio: la sequenza di riconoscimento
nel promotore dell'operone Lac:
Negli eucarioti le sequenze regolatorie presenti nelle regioni promoter
di tutti i geni sono riconosciute da fattori di trascrizione specifici.
Fattore
di trascrizione |
N. di Subunita' |
peso molecolare |
FUNZIONI |
TF II D - TBP |
1 | 38 |
riconosce
il "core" promoter richiama il TF II B |
TF II D - TAFs |
12 |
15-250 |
coopera
al processo di attivazione, coopera al processo di riconoscimento del promotore |
TF II A |
3 |
12, 19,
35 |
stabilizza
il legame tra il TF II D ed il promotore |
TF II B |
1 |
35 |
richiama
la RNA polimerasi II ed il TF II F |
TF II F | 2 |
30, 75 |
aiuta
la RNA polimerasi II a raggiungere il promotore |
TF II E | 2 |
35, 57 |
richiama
il TF II H, modula l'azione elicasica del TF II H e l'azione delle attivita' ATPase e chinasica |
TF II H | 9 |
89, 80,
62, 52 44, 40, 38, 34, 32 |
Melting
del promotore (apertura doppia elica) per azione della attivita' elicasica intrinseca, riparazione del DNA |
il TF
II E e' richiamato dalla RNA polimerasi II |
modificato da: |
Roeder, RG 1996 Trends in Biochem Sci 21:327-334 |
Fattori di trascrizione
attivati da ligando --> LINK