CURRICULUM (italiano)

1989 diploma di maturità scientifica, liceo S. Allende di Milano.

1996 laurea a pieni voti in Scienze delle Preparazioni Alimentari, Università degli Studi di Milano.

2001 Dottore di Ricerca in “Chimica, Biochimica ed Ecologia degli Antiparassitari”, titolo della tesi: "Piante geneticamente modificate e microrganismi: studi sul trasferimento genico ai fitopatogeni e sull’impatto del mais Bt, autoprotetto da Ostrinia nubilalis, sulla microflora della rizosfera e del rumine bovino"

2002 ruolo di Ricercatore nel settore scientifico-disciplinare AGR16, microbiologia agraria, Dipartimento di Scienze e Tecnologie Alimentari e Microbiologiche dell’Università degli Studi di Milano.

2008 ruolo di Professore Associato nel SSD AGR16, DiSTAM

Attività di ricerca in ambito internazionale:
1996, (borsista FEMS) Biotechnology Centre dell’Università di Oslo, Norvegia (osptie, prof.ssa A.B. Kolstø);
1999 & 2001, Federal Biological Research Centre for Agriculture and Forestry di Braunschweig, Germania (ospite, prof.ssa K. Smalla);
2001, Federal Agricultural Research Centre di Braunschweig, Germania (ospite, Prof. C. Tebbe);
2004 & 2005, Università di Tromsø, Norvegia (ospite, Prof. K. Nielsen);
2007, Rutgers University (borsista Fulbright), Institute for Marine and Coastal Sciences, New Brunswick NJ USA (ospite, Prof. C. Vetriani).

Partecipazione a campagne di campionamento in ambienti estremi:
2001, 2002, 2003, 2006, 2007 presso i bacini anossici ipersalini del mar Mediterraneo a bordo delle navi oceanografiche Urania ed Universitatis
2004, 2005, 2006, in ambiente polare presso la base artica del CNR (isole Spitzbergen, Norvegia).
2007, 2008 presso le sorgenti idrotermali profonde dell'oceano Pacifico a bordo della nave oceanografica Atlantis e sottomarino Alvin (immersioni Alvin n° 4312, 4391)
2008 nella regione Sahariana e presahariana (Tunisia) presso l'Institute Nationale des Regiones Arides (Medenine)

Socia della Società Italiana di Microbiologia e Biotecnologie Microbiche (SIMGBM), Società Italiana Microbiologia (SIM), Società Italiana Microbiolgia Agraria, Alimentare, Ambientale (SIMTREA)

ATTIVITA' DIDATTICA

“Microbiologia dei processi di risanamento ambientale”
opzionale di facoltà
il corso si svolge il 2° semestre
PROGRAMMA: www.agraria.unimi.it/didattica/programma_insegnamenti.php?codice=GGGX63&db=FM&anno=0910
LEZIONI AA 2009/2010: GIOVEDI' ORE 16.30-18.00 AULA C06

“Biotecnologie microbiche applicate alle produzioni vegetali”
corso di laurea magistrale in Scienze della Produzione e Protezione delle Piante
il corso si svolge il 1° semestre.
PROGRAMMA: www.agraria.unimi.it/didattica/programma_insegnamenti.php?codice=G59-14&db=FM&anno=0910

AA 2009/2010
Esame orale
PROSSIMI APPELLI:
giovedì 8 marzo ore 10

gli esami si svolgono nella biblioteca di microbiologia del DiSTAM (Via Mangiagalli 25, terzo piano)

Gli studenti che intendono sostenere un esame sono pregati di iscriversi via mail (sara.borin@unimi.it)

ATTIVITA' SCIENTIFICA

• Studio della diversità microbica in ambienti estremi: i bacini anossici ipersalini situati in profondità nel mediterraneo Orientale, la regione artica, le sorgenti idrotermali profonde dell'oceano Pacifico
  
• Degradazione microbica e risanamento da contaminanti chimici: caratterizzazione delle popolazioni microbiche coinvolte in processi di biorisanamento
• Studio della diversità molecolare e sviluppo di marcatori per i microrganismi del “gruppo Bacillus cereus”, con particolare riguardo all’agente di bioterrorismo B. anthracis.
• Impatto delle piante geneticamente modificate sui microrganismi dell’ambiente e scambio genico orizzontale.

poster attività del gruppo di ricerca

PUBBLICAZIONI / LAST WORKS

Van der Wielen P.W.J.J., Bolhuis H., Borin S., Daffonchio D., Corselli C., Giuliano L., de Lange G.J., Varnavas S.P., Thompson J., Tamburini C., Marty D., McGenity T.J., Timmis K., BioDeep Scientific Party. 2005. The enigma of prokaryotic life in deep hypersaline anoxic basins. Science, 307, 121-123.

Daffonchio D., Borin S., Brusa T., Brusetti L., van der Wielen P., Bolhuis H., Yakimov M., D’Auria G., Giuliano L., Marty D., Tamburini C., McGenity T., Hallsworth J., Sass A., Timmis K., Tselepides A., de Lange G., Hübner H., Thomson J., Varnavas S., Gasparoni F., Gerber H., Elisa Malinverno, Corselli C. & Biodeep Scientific Party (2006). Stratified prokaryote network in the oxic-anoxic transition of a deep sea halocline. Nature 440, 203-207

Daffonchio D, Raddadi N, Merabishvili M, Cherif A, Carmagnola L, Brusetti L, Rizzi A, Chanishvili N, Visca P, Sharp R, Borin S (2006) Strategy for identification of Bacillus cereus and Bacillus thuringiensis strains closely related to Bacillus anthracis. Applied and Environmental Microbiology, 72 (2): 1295-1301

Marzorati M, De Ferra F, Van Raemdonck H, Borin S., Allifranchini E, Carpani G, Serbolisca L, Verstraete W, Boon N, Daffonchio D. (2007). A novel reductive dehalogenase, identified in a contaminated groundwater enrichment culture and in Desulfitobacterium dichloroeliminans strain DCA1 is linked to dehalogenation of 1,2-dichloroethane. Applied and Environmental Microbiology. 73, 2990-2999.

Favia G, Ricci I, Damiani C, Raddadi N, Crotti E, Marzorati M, Rizzi A, Urso R, Brusetti L, Borin S., Mora D, Scuppa P, Pasqualini L, Clementi E, Genchi M, Corona S, Negri I, Grandi G, Alma A, Kramer L, Esposito F, Bandi C, Sacchi L, Daffonchio D. (2007). Bacteria of the genus Asaia stably associate with Anopheles stephensi, an Asian malarial mosquito vector. Proceedings Of The National Academy Of Sciences Of The United States Of America. 104, 9047-9051.

Milanesi C., Borin S., Brusetti L., Ciampolini F., Iacopini F., Baldi F. (2009) Deterioration of Medieval painting in the chapel of the Holy Nail, Siena (Italy) partially treated with Paraloid B72. International Biodegradation and Biodeterioration. on line 28 april

Borin S., Brusetti L., Daffonchio D., Delaney E., Baldi F. (2009) Biodiversity of prokaryotic communities in sediments of different sub-basins of the Venice lagoon. Research in Microbiology. 160, 307-314

Borin S., L. Brusetti, F. Mapelli, G. D’Auria, T. Brusa, M. Marzorati, A. Rizzi, M. Yakimov, D. Marty, G.J. De Lange, P. Van der Wielen, H. Bolhuis, T.J. McGenity, P.N. Polymenakou, E. Malinverno, L. Giuliano, C. Corselli, D. Daffonchio (2009) Sulfur cycling and methanogenesis primarily drive microbial colonization of the highly sulfidic Urania deep hypersaline basin. Proceedings of the National Academies of Sciences USA, 106:9151-9156.

CURRICULUM (english)

1989 Milan, secondary school diploma in scientific studies.

1996 University of Milan (Italy), graduated in “Food Science and Technology”. Title of the experimental thesis: “Molecular Ecology of the genus Bacillus and construction of a DNA probe specific for Bacillus cereus by RAPD-PCR”.

2001 University of Milan, PhD title in “Pesticide Chemistry, Biochemistry and Ecology”. Experimental thesis entitled: “Genetically modified plants and microorganisms: studies on the gene transfer to phytopathogen bacteria and on the impact of Bt corn, self-protected against Ostrinia nubilalis, on the microflora of the rhizosphere and of bovine rumen”.

2002 University of Milan, permanent position as researcher in Agricultural Microbiology

Study abroad:
1996, (FEMS fellowship) Biotecnology Centre of Oslo University Norway (host, prof. A-B Kolsto)
1999 & 2001, Federal Biological Research Centre for Agriculture and Forestry of Braunschweig Germany (host, prof. K. Smalla);
2001, Federal Agricultural Research Centre of Braunschweig Germany (host, prof. C. Tebbe);
2004 & 2005, Tromso University Norway (host prof. K. M. Nielsen).
2007, (Fulbright grant) Institute for Marine and Coastal Sciences, Rutgers University, New Brunswick NJ USA (host prof. C. Vetriani).

International research expeditions:
2001, 2002, 2003, 2006, 2007 participation to oceanographic cruises on the deep anoxic hypersaline basins of the Mediterranean sea on the research vessels Urania and Universitatis.
2004 , 2005, 2006 participation to sampling expeditions at the arctic base of the Italian National Research Council in Ny-Ålesund (Spitzbergen islands, Norway).
2007 & 2008 participation to the AT 15-15 and AT15-28 oceanographic cruises of the research vessel Atlantis with the deep submergence vehicle Alvin (dives 4312, 4391).
2008 participation to the BiodesertI sampling expedition in the subsaharian and saharian region (Tunisia) hosted by the Institute Nationale des Regions Arides (Medenine)

TEACHING ACTIVITY

University of Milan, master degree on Plant Protection:
Agricultural Microbiology

University of Milan, master degree in Agricultural Biotechnology:
Microbiology of bioremediation processes

SCIENTIFIC ACTIVITY

• Study of bacterial biodiversity in extreme environments: the deep hypersaline anoxic basins of the Mediterranean Sea, the deepsea hydrothermal vents of the Pacific ocean, the arctic environment
  
• Genetic and phenotypic diversity among the “Bacillus cereus group”.
• Characterization of the microflora involved in bioremediation processes.
• Genetically Modified Plants and bacteria.
• Biodeterioration of stone artworks by microorganisms.

poster research group activities

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